Benvinguda
Maig 2009 
Nou equipament per a
l'emmagatzematge de dades
El Servei d'Emmagatzematge de Dades s'ha renovat amb la
instal·lació d'una cabina NetApp FAS3170,
adquirida a Satec, que incrementa la capacitat
d'emmagatzematge del Centre de 16,5 a 61,7 TB, beneficiant
els projectes i serveis que necessiten tant alta capacitat en
disc, com ara PADICAT, com accés a discos d'alt
rendiment, com ara GAIA.La posada en marxa del NetApp permetrà que l'espai d'emmagatzematge per al repositori Patrimoni Digital de Catalunya (PADICAT) es dobli, passant de 7 a 14 TB. PADICAT va iniciar-se el 2006 amb una capacitat inicial de 30 GB que es va anant ampliant successivament fins a 7 TB el 2008. Ara disposarà de 14 TB ampliables segons les necessitats. D'altra banda, el repositori Memòria Digital de Catalunya (MDC) del CBUC comptarà amb 2 TB d'espai, abans disposava de 700 GB. Altres projectes com GAIA, que té per objectiu el disseny d'una base de dades estel·lar, comptarà amb 8 TB.
Pel que fa al servei de Càlcul d'Altes Prestacions, es doblarà l'espai total disponible, passant de 2 a 4 TB. Així, s'engradiran les dues àrees principals de treball dels usuaris del servei, l'àrea de dades d'usuari, /home i l'àrea de treball temporal /cescascratch. L'àrea /home, que ara disposa de 400 GB, creixerà fins a 1 TB. Això permetrà incrementar les quotes definides per usuari que hi havia fins ara, qua passaran de 512 MB a 2 GB. També s'ampliaran les quotes de grup. Pel que fa a l'àrea /cescascratch es quadruplicarà la seva mida, passant de 512 GB a 2 TB.
Ambdues ampliacions permetran donar resposta a la necessitat creixent d'emmagatzemar fitxers d'entrada i sortida de càlculs cada vegada més voluminosos. A més, la nova cabina, al oferir un rendiment superior a l'hora de servir fitxers per NFS, millorarà la qualitat del servei i el rendiment d'aquells treballs que facin ús de les àrees compartides.
La Cabina NetApp FAS3170
NetApp té
dues controladores de 32 GB de memòria cau cadascuna
(64 GB en total), 56 discos Fiber Channel (FC) de 300 GB a
15.000 rpm, 84 discos d'1 TB a 7.200 rpm, dos commutadors
Cisco MDS9134 FC de 64 ports actius a 4 Gbps i dos
commutadors Cisco WS-C3750G-24TS de 24 ports Gigabit
Ethernet. Disposa d'11 TB nets d'alt rendiment i 51 TB d'alta
capacitat. A més, es tracta d'un sistema escalable, ja
que es pot augmentar fàcilment la seva capacitat
d'emmagatzematge fins a 840 TB. Compta amb operativa dual,
capaç de gestionar els entorns SAN i NAS de manera
independent i simultània, i amb una arquitectura
totalment redundada, d'alta disponibilitat.En quant a prestacions, redueix a la meitat el temps necessari per a les operacions de backup i recuperació de dades i afavoreix la gestió a través de servidors virtualitzats. En aquest sentit, realitza snapshots (captures dels fitxers en un moment determinat per poder recuperar-los en un futur) dels volums desitjats, fins a 255 d'un mateix volum. També, permet la creació d'snapshots incrementals des de la primera còpia, de manera que l'optimització d'espai és òptima, sense necessitat d'una còpia completa inicial.
A més, la tecnologia RAID-DP, propietària de NetApp, augmenta la protecció i preservació de les dades, ja que en garanteix la seva seguretat, tant davant de la fallada simultània de dos discos, com de dos errors de lectura o bé una fallada d'un disc i un error de lectura, amb un mínim d'impacte en el rendiment.
El programari que usa NetApp és Data ONTAP 7G, un sistema operatiu de tipus micronucli (microkernel), altament optimitzat, escalable i flexible, que ha estat dissenyat per NetApp per construir sistemes d'emmagatzematge unificat mutiprotocol.
Disposa també d'un clúster redundant, format per dos nodes HP DL320 G5p, que ubica el servidor d'autenticació d'usuaris i el gestor de llicències del programari del Servei de Càlcul d'Altes Prestacions. Cada node disposa d'un processador Intel Xeon E3110 de doble nucli a 3,0 GHz, 8 GB de memòria principal PC2-6400, dos discos SATA de 250 GB a 7.200 rpm, configurats en RAID 1, i un adaptador FC de 4 Gbps.
La migració de les dades del subsistema de discos EVA a la nova cabina d'emmagatzematge s'ha anat realitzant de forma gradual. Els repositoris PADICAT i MDC, ja han migrat les seves dades i s'espera que es completi la migració de la resta de serveis a finals del mes de maig.
El CRG amplia la seva
connexió a l'Anella Científica a 1
Gbps
El Centre de Regulació Genòmica (CRG) ha ampliat la seva connexió directa a l'Anella Científica de 900 Mbps a 1 Gbps. El CRG també disposa d'un port dedicat de 100 Mbps compartit amb la Universitat Pompeu Fabra (UPF).
La connexió directa d'1 Gbps s'usa per al tràfic de recerca en genòmica que realitza el CRG i la compartida amb la UPF, per al tràfic regular. A més, cada connexió fa de backup de l'altra, de manera que si cau una l'altra assumeix tot el tràfic i al contrari.
El CRG és un centre de recerca biomèdica que té com a objectiu promoure una recerca d'excel·lència centrada en els àmbits de la genòmica i la proteòmica. En concret, té el compromís de cercar nous camins d'estudi del genoma i actuar contra les malalties associades als errors genètics des de la perspectiva única i singular de cada ésser humà. Així, el CRG fa recerca en regulació gènica, epigenètica, cèl·lules mare, diferenciació cel·lular, càncer, genètica mèdica, malalties neurodegeneratives, biologia computacional...
El Centre es troba integrat dins el Parc de Recerca Biomèdica de Barcelona i està format per diferents grups de recerca que s'agrupen en programes que contemplen les principals línies d'investigació del CRG: bioinformàtica i genòmica, biologia cel·lular i desenvolupament, diferenciació i càncer, regulació gènica, gens i malaltia, i biologia de sistemes.
Nou armari central per al cablatge
de la Sala de Màquines
S'ha instal·lat un nou armari central de cablatge (ACC) per a la Sala de Màquines del Centre que servirà per fer les interconnexions entre els diferents sistemes que hi han en funcionament.
L'armari és un Retex de 42 posicions U de 19 polzades d'amplada amb elements de suport per guiar el cablejat vertical i horitzontalment, taulers de connexió (patch-panels) de fibra i coure, i l'electrònica principal de la xarxa d'emmagatzematge, serveis, i gestió i monitoratge. A ell arriben els enllaços de fibra, habitualment multimode, i coure, principalment categoria 6, que provenen dels armaris principals de la Sala de Màquines. Així, la interconnexió es realitza entre aquests armaris i l'armari central amb cablatge estructurat amb corrugats de protecció i, per als enllaços més crítics, amb dues rutes diferents.
El principal avantatge que aporta el nou armari central de cablatge és la flexibilitat, ja que permet interconnectar dos sistemes o equips de xarxa que estiguin en armaris diferents sense haver d'instal·lar enllaços directes entre ells. D'aquesta manera, quan s'instal·la un nou sistema, només cal fer arribar el cablejat cap a l'armari principal i a partir d'aquí ja es pot interconnectar amb la resta d'armaris, segons les necessitats. A més, l'ACC també facilita la gestió del cablejat del fals terra tècnic de la Sala de Màquines i la conseqüent adaptació a noves necessitats de manera fàcil i òptima.
El nou servidor de càlcul
Bull, en marxa
S'ha instal·lat el nou servidor de càlcul
Bull NovaScale, anomenat prades, que disposa d'un total
de 240 nuclis i que ha incrementat el rendiment punta del
Centre a 4,13 Tflop/s. Amb la incorporació d'aquest
servidor, els usuaris disposen ara d'un sistema
clúster de memòria distribuïda d'alta
velocitat gràcies a la xarxa InfiniBand, que
complementa les prestacions del clúster HP CP4000, amb
xarxa Gigabit Ethernet, i del sistema SGI Altix, de
memòria compartida.El nou Bull NovaScale és un clúster integrat per 14 servidors R422E1 amb 28 nodes i 56 processadors Xeon de 4 nuclis (224 en total) a 3,0 GHz, amb 896 GB de memòria principal i 31,72 TB de disc. També disposa d'un servidor amb dos nodes per a gestió i accés, cadascun d'ells amb dos processadors (de 4 nuclis) a 2,5 GHz, amb 1,16 TB d'espai en disc i 8 i 16 GB de memòria respectivament. Aquest clúster pot realitzar 2.688 milions d'operacions de coma flotant per segon, és a dir, té un rendiment punta de 2,7 Tflop/s.
El servidor Bull NovaScale R422E1, de la família 5400 Harpertown de quatre nuclis, és un servidor dual ultra dens i molt eficient en cost especialment dissenyat com a node de càlcul dins de clústers de supercomputació. La seva arquitectura modular enracable amb 2 nodes en 1U permet l'expansió d'alguns elements a mesura que es requereixi de més capacitat. Així, a l'armari només s'hi ocupen 20 de les 42U disponibles, restant 22U lliures per a possibles ampliacions.
El processador Xeon 5400, de què disposa prades, ha duplicat l'amplada de banda dedicada per processador respecte els seus predecessors, amb un bus dedicat per a cada un dels dos sòcols (sockets) de Bensley. Això permet a cada sòcol de 2 a 4 nuclis tenir una amplada de banda dedicada per operar amb la resta del sistema sense interferir amb l'altre. Per a cada sòcol hi ha una amplada de banda de 10,5 GB/s, ja que aquest bus treballa a 1.600 MHz. La família Harpertown utilitza procés de fabricació de 45 nm. Cada dos nuclis del xip comparteixen una memòria cau L2 comuna de 6 MB. L'espai en aquesta memòria cau és usat dinàmicament segons les necessitats de cada nucli, i cada nucli pot passar dades a l'altre a través d'aquesta memòria cau.
El clúster disposa de tres xarxes, una de gestió i una de serveis, Gigabit Ethernet (GbE) i, per a càlcul, una xarxa InfiniBand, que permet optimitzar el rendiment de les aplicacions moderadament paral·leles. Per a la xarxa GbE es disposa d'un commutador Foundry FLS648 de 48 ports Gbit amb un port de 10 GB. Les sèries de commutadors Falcon LS de nivell dos d'alt rendiment proporcionen funcionalitats completes, segures i resistents amb un disseny compacte.
Per a la xarxa InfiniBand, es disposa de dos commutadors Infiniband Voltaire ISR 9024D-M, 24 4X DDR ports, un gestionat internament i l'altre externament. A més, cada node disposa d'una targeta InfiniBand Mellanox ConnectX Dual Ports 4X DDR.
Aquesta configuració, a més d'una major flexibilitat, permet la creació de tres xarxes totalment independents amb únicament dos commutadors, ja que estan enllaçats mitjançant una connexió per a l'entroncament entre els commutadors i, a la vegada, amb la resta de nodes de la xarxa usant un altre enllaç per a la connectivitat de la xarxa de serveis (NFS).
Quant a programari, prades ofereix un entorn de clúster anomenat Bull Advanced Server for Xeon, un paquet per a clúster HPC que permet gestionar milers de nodes. Aquest paquet inclou RedHat Enterprise Linux 5 i NovaScale Master HPC Edition for cluster management, que permet l'administració i el monitoratge del clúster com una eina potent a través d'una interfície web gens complicada que simplifica operacions rutinàries.
Nova versió de Gnuplot a
prades
Ha quedat instal·lada al NovaScale (prades) la versió 4.2.5 de Gnuplot. Aquest és un programari en línia de comandes que permet dibuixar gràfiques de funcions en 2 i 3 dimensions mitjançant les seves fòrmules matemàtiques o fent servir taules de coordenades creades amb qualsevol altre programa. A part de dibuixar la gràfica en pantalla, permet exportar-la a diferents formats com ara jpg, png, pdf o eps, entre d'altres. Gnuplot té copyright però es distribuiex lliurement i es pot obtenir de la seva pàgina web.
L'Anella Científica participa
en la primera retransmissió 3D en directe
d'Espanya
L'Anella
Científica ha participat en la primera
retransmissió en directe amb tecnologia 3D i qualitat
cinematogràfica realitzada durant la cinquena
edició del Digital Barcelona Film Festival (DiBa
2009), un esdeveniment que vol unir el cinema digital amb les
darreres tendències innovadores i que ha tingut lloc
del 17 al 24 de maig.Dins d'aquest festival, el dia 19 de maig ha tingut lloc una demostració de retransmissió en directe d'imatges en tres dimensions, que gràcies als avenços en tecnologia estereoscòpica han permès l'aplicació de la tecnologia 3D a les retransmissions en directe. La filmació de les imatges en 3D s'ha realitzat usant quatre parells de càmeres d'alta definició que junt amb un sistema de control estereoscòpic han permès comprimir les imatges JPEG2000 en senyal IP.
En concret, els assistents a l'Auditori de la Universitat Pompeu Fabra (UPF) han pogut seguir, usant unes ulleres polaritzades especials, en directe i en tres dimensions un assaig de l'òpera Fidelio de Beethoven (producció de la Metropolitan Opera House de Nova York) que s'ha retransmès des del Gran Teatre del Liceu fins a la UPF.
La retransmissió s'ha dut a terme gràcies a la col·laboració de diverses empreses, que han aportat els seus serveis de cinematografia, sistemes de projecció i alta definició, i institucions com i2CAT, la UPF, el Gran Teatre del Liceu i el CESCA, que ha proveït la connexió entre el Gran Teatre del Liceu i i2CAT a través de l'Anella Científica. Així, s'ha habilitat entre ambdues institucions un circuit de nivell 2 de 500 Mbps i un segon circuit, entre el Liceu i la UPF, com a backup del circuit principal.
Els punts neutres del sud d'Europa
s'uneixen per potenciar-hi el tràfic
d'internet
Representants dels punts neutres de Catalunya (CATNIX),
Madrid (ESpanix), Torí (TOP-IX), Milà (MIX),
Roma (NaMeX) i Lió (LYONIX) han signat un conveni de
col·laboració amb l'objectiu de promoure i
potenciar el tràfic d'internet del sud d'Europa i
reduir d'aquesta manera les diferències existents amb
el del nord.Aquest acord es materialitza amb la creació del Southern European Internet Exchange Points (SEIXP), un grup format pels membres signants i obert a tots els punts neutres de la zona, l'objectiu del qual serà reduir les diferències amb el nord d'Europa pel que fa a l'intercanvi de tràfic d'internet en el qual participen nodes neutres. La seva principal àrea d'interès serà el sud d'Europa, però també l'àmbit mediterrani i l'Orient Mitjà, com a regions on potenciar i desenvolupar el tràfic d'internet.
El conveni de col·laboració estableix que, per fomentar el creixement en aquestes àrees d'interès, els membres del SEIXP desenvoluparan activitats conjuntes, com ara la creació d'un butlletí per fomentar el debat i la cooperació en diferents temes tècnics i comercials i crear mercat. El grup, que estarà dirigit per un comitè directiu format per un representant de cadascun dels membres, també ha acordat celebrar esdeveniments conjunts per tal de crear una xarxa social entre els nodes neutres membres i millorar-ne la cooperació.
En la signatura del conveni han participat Jordi Bosch, president de la Comissió Estratègica del CATNIX; Cristóbal López, gerent d'Espanix; Maurizio Goretti, conseller delegat de Namex; Luca Cicchelli, delegat per Topix i MIX, i Samuel Triolet, director de Lyonix.
L'EUSS, nou membre
d'Eduroam
L'Escola Universitària Salesiana de Sarrià (EUSS) s'ha incorporat al servei Eduroam, que facilita la mobilitat dels investigadors i els estudiants europeus oferint-los connectivitat en els seus desplaçaments a la resta d'institucions participants. La connexió a Eduroam s'efectua a través de la xarxa sense fil de l'EUSS mitjançant l'estàndard 802.1x. Així, els investigadors o estudiants que visiten l'EUSS disposen d'accés a la seva xarxa usant les mateixes credencials que fan servir per autenticar-se en la seva institució d'origen.
L'EUSS impulsada i tutelada per la Fundació Rinaldi, és un centre docent d'ensenyament superior que ofereix titulacions d'enginyeria, preferentment en la branca industrial, complementades amb programes de postgrau i màsters propis.
Amb aquesta, ja són 17 les institucions de l'Anella Científica que ofereixen el servei de mobilitat Eduroam.
Nova institució i revistes a
RACO
La Societat Catalana per a la Recerca en Intel·ligència Competitiva s'ha incorporat al repositori Revistes Catalanes amb Accés Obert (RACO) amb la seva publicació Quaderns d'intel·ligència competitiva, vigilància estratègica, científica i tecnològica (QUIC&VECT) que també s'edita en anglès amb el títol International Journal of Competitive Intelligence, Strategic, Scientific and Technology Watch (SCI&WATCH) i en castellà amb el títol Cuadernos de inteligencia competitiva, vigilancia estratégica, científica y tecnológica (QUIC&VECT). Les tres edicions es troben disponibles a RACO des del seu volum primer de 2008.
QUIC&VECT és una publicació adreçada a tots els professionals i investigadors de l'àmbit de la vigilància tecnològica, la intel·ligència competitiva, l'R+D+I i la gestió estratègica de la informació a les organitzacions. A més, també recull en format article, una selecció d'alguns dels treballs presentats en el congrés Veille Stratégique Scientifique & Technologique organitzat per l'Institut de Recherche Informatique de Toulouse.
D'altra banda, també s'hi han incorporat dues publicacions més. La primera, Catalan Historical Review de l'Institut d'Estudis Catalans i la segona, Miscellanea Aqualatensia del Centre d'Estudis Comarcals d'Igualada.
Amb aquestes darreres incoporacions RACO disposa de 238 revistes de 49 institucions participants.
